Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDC1Q9BTX1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NDC1Q9BTX1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms