Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYT17Q9BSW7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYT17Q9BSW7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYT17Q9BSW7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYT17Q9BSW7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYT17Q9BSW7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYT17Q9BSW7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYT17Q9BSW7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYT17Q9BSW7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYT17Q9BSW7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYT17Q9BSW7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYT17Q9BSW7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYT17Q9BSW7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYT17Q9BSW7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYT17Q9BSW7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYT17Q9BSW7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYT17Q9BSW7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYT17Q9BSW7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYT17Q9BSW7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYT17Q9BSW7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYT17Q9BSW7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SYT17Q9BSW7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYT17Q9BSW7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYT17Q9BSW7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYT17Q9BSW7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYT17Q9BSW7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYT17Q9BSW7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYT17Q9BSW7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYT17Q9BSW7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYT17Q9BSW7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SYT17Q9BSW7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYT17Q9BSW7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYT17Q9BSW7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SYT17Q9BSW7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SYT17Q9BSW7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYT17Q9BSW7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYT17Q9BSW7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYT17Q9BSW7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYT17Q9BSW7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYT17Q9BSW7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYT17Q9BSW7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYT17Q9BSW7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYT17Q9BSW7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYT17Q9BSW7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYT17Q9BSW7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYT17Q9BSW7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYT17Q9BSW7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYT17Q9BSW7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYT17Q9BSW7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYT17Q9BSW7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYT17Q9BSW7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYT17Q9BSW7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SYT17Q9BSW7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SYT17Q9BSW7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYT17Q9BSW7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYT17Q9BSW7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYT17Q9BSW7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYT17Q9BSW7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SYT17Q9BSW7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYT17Q9BSW7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYT17Q9BSW7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYT17Q9BSW7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYT17Q9BSW7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYT17Q9BSW7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYT17Q9BSW7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYT17Q9BSW7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYT17Q9BSW7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYT17Q9BSW7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYT17Q9BSW7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYT17Q9BSW7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYT17Q9BSW7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYT17Q9BSW7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYT17Q9BSW7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYT17Q9BSW7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYT17Q9BSW7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYT17Q9BSW7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYT17Q9BSW7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYT17Q9BSW7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SYT17Q9BSW7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYT17Q9BSW7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYT17Q9BSW7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYT17Q9BSW7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYT17Q9BSW7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SYT17Q9BSW7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SYT17Q9BSW7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SYT17Q9BSW7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SYT17Q9BSW7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SYT17Q9BSW7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SYT17Q9BSW7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SYT17Q9BSW7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYT17Q9BSW7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYT17Q9BSW7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYT17Q9BSW7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SYT17Q9BSW7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYT17Q9BSW7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYT17Q9BSW7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYT17Q9BSW7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYT17Q9BSW7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYT17Q9BSW7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYT17Q9BSW7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms