Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SRSF8Q9BRL6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms