Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQT9

CLSTN3, Calsyntenin-3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3Q9BQT9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSTN3Q9BQT9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSTN3Q9BQT9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSTN3Q9BQT9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSTN3Q9BQT9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSTN3Q9BQT9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSTN3Q9BQT9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSTN3Q9BQT9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSTN3Q9BQT9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSTN3Q9BQT9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLSTN3Q9BQT9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms