Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
PMCHL2Q9BQD1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms