Protein–RNA interactions for Protein: Q99788

CMKLR1, Chemokine-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMKLR1Q99788 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CMKLR1Q99788 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms