Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms