Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CRBNQ96SW2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CRBNQ96SW2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CRBNQ96SW2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CRBNQ96SW2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CRBNQ96SW2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CRBNQ96SW2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CRBNQ96SW2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CRBNQ96SW2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CRBNQ96SW2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CRBNQ96SW2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CRBNQ96SW2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CRBNQ96SW2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CRBNQ96SW2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CRBNQ96SW2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CRBNQ96SW2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms