Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ3

MCCC1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC1Q96RQ3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCC1Q96RQ3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms