Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HHIPQ96QV1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HHIPQ96QV1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HHIPQ96QV1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HHIPQ96QV1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HHIPQ96QV1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HHIPQ96QV1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HHIPQ96QV1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HHIPQ96QV1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HHIPQ96QV1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HHIPQ96QV1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HHIPQ96QV1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HHIPQ96QV1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HHIPQ96QV1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HHIPQ96QV1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HHIPQ96QV1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HHIPQ96QV1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HHIPQ96QV1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HHIPQ96QV1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HHIPQ96QV1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HHIPQ96QV1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HHIPQ96QV1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HHIPQ96QV1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HHIPQ96QV1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HHIPQ96QV1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HHIPQ96QV1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HHIPQ96QV1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HHIPQ96QV1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HHIPQ96QV1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HHIPQ96QV1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HHIPQ96QV1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HHIPQ96QV1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HHIPQ96QV1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HHIPQ96QV1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HHIPQ96QV1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HHIPQ96QV1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HHIPQ96QV1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HHIPQ96QV1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HHIPQ96QV1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HHIPQ96QV1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HHIPQ96QV1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HHIPQ96QV1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HHIPQ96QV1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms