Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
OPALINQ96PE5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
OPALINQ96PE5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
OPALINQ96PE5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
OPALINQ96PE5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
OPALINQ96PE5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
OPALINQ96PE5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
OPALINQ96PE5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
OPALINQ96PE5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
OPALINQ96PE5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
OPALINQ96PE5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
OPALINQ96PE5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
OPALINQ96PE5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
OPALINQ96PE5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
OPALINQ96PE5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
OPALINQ96PE5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
OPALINQ96PE5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
OPALINQ96PE5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
OPALINQ96PE5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms