Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms