Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
JSRP1Q96MG2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
JSRP1Q96MG2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
JSRP1Q96MG2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
JSRP1Q96MG2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
JSRP1Q96MG2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
JSRP1Q96MG2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
JSRP1Q96MG2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms