Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
GJD4Q96KN9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
GJD4Q96KN9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
GJD4Q96KN9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GJD4Q96KN9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GJD4Q96KN9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
GJD4Q96KN9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
GJD4Q96KN9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GJD4Q96KN9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GJD4Q96KN9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
GJD4Q96KN9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GJD4Q96KN9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GJD4Q96KN9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GJD4Q96KN9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GJD4Q96KN9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
GJD4Q96KN9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
GJD4Q96KN9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
GJD4Q96KN9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
GJD4Q96KN9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
GJD4Q96KN9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GJD4Q96KN9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GJD4Q96KN9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GJD4Q96KN9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GJD4Q96KN9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GJD4Q96KN9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GJD4Q96KN9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GJD4Q96KN9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GJD4Q96KN9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GJD4Q96KN9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GJD4Q96KN9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
GJD4Q96KN9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
GJD4Q96KN9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
GJD4Q96KN9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
GJD4Q96KN9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GJD4Q96KN9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
GJD4Q96KN9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GJD4Q96KN9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GJD4Q96KN9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GJD4Q96KN9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GJD4Q96KN9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GJD4Q96KN9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GJD4Q96KN9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GJD4Q96KN9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
GJD4Q96KN9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
GJD4Q96KN9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GJD4Q96KN9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GJD4Q96KN9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
GJD4Q96KN9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
GJD4Q96KN9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GJD4Q96KN9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GJD4Q96KN9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GJD4Q96KN9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GJD4Q96KN9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GJD4Q96KN9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GJD4Q96KN9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GJD4Q96KN9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GJD4Q96KN9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GJD4Q96KN9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GJD4Q96KN9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GJD4Q96KN9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
GJD4Q96KN9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GJD4Q96KN9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GJD4Q96KN9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GJD4Q96KN9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GJD4Q96KN9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GJD4Q96KN9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GJD4Q96KN9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms