Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPGRIP1Q96KN7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms