Protein–RNA interactions for Protein: Q96KJ9

COX4I2, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I2Q96KJ9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COX4I2Q96KJ9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COX4I2Q96KJ9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COX4I2Q96KJ9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COX4I2Q96KJ9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COX4I2Q96KJ9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COX4I2Q96KJ9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
COX4I2Q96KJ9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
COX4I2Q96KJ9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COX4I2Q96KJ9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COX4I2Q96KJ9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COX4I2Q96KJ9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COX4I2Q96KJ9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COX4I2Q96KJ9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COX4I2Q96KJ9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COX4I2Q96KJ9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COX4I2Q96KJ9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COX4I2Q96KJ9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COX4I2Q96KJ9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COX4I2Q96KJ9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COX4I2Q96KJ9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COX4I2Q96KJ9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COX4I2Q96KJ9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COX4I2Q96KJ9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COX4I2Q96KJ9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
COX4I2Q96KJ9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
COX4I2Q96KJ9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COX4I2Q96KJ9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COX4I2Q96KJ9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
COX4I2Q96KJ9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COX4I2Q96KJ9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms