Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CELF6Q96J87 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms