Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC12Q96J65 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC12Q96J65 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC12Q96J65 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC12Q96J65 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC12Q96J65 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC12Q96J65 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC12Q96J65 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC12Q96J65 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC12Q96J65 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC12Q96J65 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC12Q96J65 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC12Q96J65 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC12Q96J65 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC12Q96J65 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC12Q96J65 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC12Q96J65 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC12Q96J65 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC12Q96J65 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC12Q96J65 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC12Q96J65 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC12Q96J65 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC12Q96J65 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC12Q96J65 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC12Q96J65 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC12Q96J65 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC12Q96J65 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC12Q96J65 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC12Q96J65 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC12Q96J65 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC12Q96J65 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC12Q96J65 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ABCC12Q96J65 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
ABCC12Q96J65 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC12Q96J65 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC12Q96J65 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC12Q96J65 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC12Q96J65 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC12Q96J65 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC12Q96J65 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ABCC12Q96J65 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ABCC12Q96J65 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ABCC12Q96J65 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ABCC12Q96J65 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ABCC12Q96J65 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ABCC12Q96J65 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ABCC12Q96J65 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ABCC12Q96J65 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC12Q96J65 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC12Q96J65 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC12Q96J65 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC12Q96J65 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC12Q96J65 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC12Q96J65 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC12Q96J65 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC12Q96J65 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC12Q96J65 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC12Q96J65 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC12Q96J65 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC12Q96J65 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC12Q96J65 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC12Q96J65 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC12Q96J65 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC12Q96J65 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC12Q96J65 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC12Q96J65 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC12Q96J65 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC12Q96J65 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCC12Q96J65 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCC12Q96J65 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCC12Q96J65 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCC12Q96J65 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCC12Q96J65 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCC12Q96J65 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCC12Q96J65 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC12Q96J65 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC12Q96J65 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC12Q96J65 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC12Q96J65 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCC12Q96J65 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCC12Q96J65 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCC12Q96J65 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCC12Q96J65 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCC12Q96J65 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCC12Q96J65 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCC12Q96J65 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ABCC12Q96J65 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ABCC12Q96J65 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ABCC12Q96J65 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ABCC12Q96J65 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ABCC12Q96J65 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ABCC12Q96J65 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ABCC12Q96J65 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ABCC12Q96J65 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCC12Q96J65 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCC12Q96J65 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCC12Q96J65 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCC12Q96J65 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCC12Q96J65 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCC12Q96J65 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms