Protein–RNA interactions for Protein: Q96IY1

NSL1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSL1Q96IY1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NSL1Q96IY1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms