Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SGSM3Q96HU1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms