Protein–RNA interactions for Protein: Q96G28

CFAP36, Cilia- and flagella-associated protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP36Q96G28 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP36Q96G28 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP36Q96G28 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP36Q96G28 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP36Q96G28 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP36Q96G28 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP36Q96G28 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP36Q96G28 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP36Q96G28 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP36Q96G28 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP36Q96G28 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP36Q96G28 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP36Q96G28 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP36Q96G28 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP36Q96G28 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP36Q96G28 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP36Q96G28 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP36Q96G28 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP36Q96G28 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP36Q96G28 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP36Q96G28 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP36Q96G28 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP36Q96G28 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP36Q96G28 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP36Q96G28 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP36Q96G28 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP36Q96G28 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP36Q96G28 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP36Q96G28 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms