Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms