Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ATG4CQ96DT6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATG4CQ96DT6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATG4CQ96DT6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATG4CQ96DT6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATG4CQ96DT6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATG4CQ96DT6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATG4CQ96DT6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATG4CQ96DT6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATG4CQ96DT6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
ATG4CQ96DT6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATG4CQ96DT6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATG4CQ96DT6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATG4CQ96DT6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATG4CQ96DT6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATG4CQ96DT6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATG4CQ96DT6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATG4CQ96DT6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATG4CQ96DT6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ATG4CQ96DT6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATG4CQ96DT6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATG4CQ96DT6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATG4CQ96DT6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATG4CQ96DT6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATG4CQ96DT6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATG4CQ96DT6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ATG4CQ96DT6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATG4CQ96DT6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATG4CQ96DT6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATG4CQ96DT6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATG4CQ96DT6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATG4CQ96DT6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATG4CQ96DT6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATG4CQ96DT6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATG4CQ96DT6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATG4CQ96DT6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ATG4CQ96DT6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATG4CQ96DT6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATG4CQ96DT6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATG4CQ96DT6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATG4CQ96DT6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATG4CQ96DT6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATG4CQ96DT6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATG4CQ96DT6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATG4CQ96DT6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATG4CQ96DT6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATG4CQ96DT6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATG4CQ96DT6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATG4CQ96DT6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATG4CQ96DT6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.8 ms