Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN2

VWCE, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWCEQ96DN2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VWCEQ96DN2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms