Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C18orf8Q96DM3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C18orf8Q96DM3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C18orf8Q96DM3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C18orf8Q96DM3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C18orf8Q96DM3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C18orf8Q96DM3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C18orf8Q96DM3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C18orf8Q96DM3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C18orf8Q96DM3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
C18orf8Q96DM3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C18orf8Q96DM3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C18orf8Q96DM3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C18orf8Q96DM3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C18orf8Q96DM3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C18orf8Q96DM3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C18orf8Q96DM3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C18orf8Q96DM3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C18orf8Q96DM3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C18orf8Q96DM3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C18orf8Q96DM3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C18orf8Q96DM3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C18orf8Q96DM3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C18orf8Q96DM3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C18orf8Q96DM3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C18orf8Q96DM3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
C18orf8Q96DM3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C18orf8Q96DM3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
C18orf8Q96DM3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C18orf8Q96DM3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C18orf8Q96DM3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
C18orf8Q96DM3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms