Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PGBD4Q96DM1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PGBD4Q96DM1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PGBD4Q96DM1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PGBD4Q96DM1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PGBD4Q96DM1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PGBD4Q96DM1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PGBD4Q96DM1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PGBD4Q96DM1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PGBD4Q96DM1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PGBD4Q96DM1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PGBD4Q96DM1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PGBD4Q96DM1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PGBD4Q96DM1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PGBD4Q96DM1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PGBD4Q96DM1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PGBD4Q96DM1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PGBD4Q96DM1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PGBD4Q96DM1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PGBD4Q96DM1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PGBD4Q96DM1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PGBD4Q96DM1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PGBD4Q96DM1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PGBD4Q96DM1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PGBD4Q96DM1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PGBD4Q96DM1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PGBD4Q96DM1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PGBD4Q96DM1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PGBD4Q96DM1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PGBD4Q96DM1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PGBD4Q96DM1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PGBD4Q96DM1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PGBD4Q96DM1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGBD4Q96DM1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGBD4Q96DM1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGBD4Q96DM1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PGBD4Q96DM1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGBD4Q96DM1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGBD4Q96DM1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGBD4Q96DM1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PGBD4Q96DM1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGBD4Q96DM1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGBD4Q96DM1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGBD4Q96DM1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PGBD4Q96DM1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PGBD4Q96DM1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PGBD4Q96DM1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PGBD4Q96DM1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PGBD4Q96DM1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PGBD4Q96DM1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PGBD4Q96DM1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PGBD4Q96DM1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms