Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SHISA4Q96DD7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SHISA4Q96DD7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHISA4Q96DD7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHISA4Q96DD7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHISA4Q96DD7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHISA4Q96DD7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHISA4Q96DD7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHISA4Q96DD7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHISA4Q96DD7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHISA4Q96DD7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHISA4Q96DD7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHISA4Q96DD7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHISA4Q96DD7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHISA4Q96DD7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHISA4Q96DD7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHISA4Q96DD7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SHISA4Q96DD7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHISA4Q96DD7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHISA4Q96DD7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHISA4Q96DD7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHISA4Q96DD7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHISA4Q96DD7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SHISA4Q96DD7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHISA4Q96DD7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHISA4Q96DD7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHISA4Q96DD7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHISA4Q96DD7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHISA4Q96DD7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHISA4Q96DD7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHISA4Q96DD7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHISA4Q96DD7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHISA4Q96DD7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHISA4Q96DD7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SHISA4Q96DD7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SHISA4Q96DD7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SHISA4Q96DD7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SHISA4Q96DD7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SHISA4Q96DD7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHISA4Q96DD7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHISA4Q96DD7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHISA4Q96DD7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHISA4Q96DD7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHISA4Q96DD7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHISA4Q96DD7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHISA4Q96DD7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHISA4Q96DD7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SHISA4Q96DD7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHISA4Q96DD7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHISA4Q96DD7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHISA4Q96DD7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHISA4Q96DD7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHISA4Q96DD7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHISA4Q96DD7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHISA4Q96DD7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SHISA4Q96DD7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHISA4Q96DD7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHISA4Q96DD7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHISA4Q96DD7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHISA4Q96DD7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHISA4Q96DD7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHISA4Q96DD7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHISA4Q96DD7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SHISA4Q96DD7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SHISA4Q96DD7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHISA4Q96DD7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHISA4Q96DD7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHISA4Q96DD7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHISA4Q96DD7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHISA4Q96DD7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHISA4Q96DD7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHISA4Q96DD7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHISA4Q96DD7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SHISA4Q96DD7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHISA4Q96DD7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHISA4Q96DD7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHISA4Q96DD7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHISA4Q96DD7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SHISA4Q96DD7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SHISA4Q96DD7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SHISA4Q96DD7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SHISA4Q96DD7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SHISA4Q96DD7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHISA4Q96DD7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHISA4Q96DD7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHISA4Q96DD7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHISA4Q96DD7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHISA4Q96DD7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SHISA4Q96DD7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHISA4Q96DD7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHISA4Q96DD7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHISA4Q96DD7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHISA4Q96DD7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHISA4Q96DD7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHISA4Q96DD7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHISA4Q96DD7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHISA4Q96DD7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHISA4Q96DD7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHISA4Q96DD7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHISA4Q96DD7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms