Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms