Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP13Q92995 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP13Q92995 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP13Q92995 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP13Q92995 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP13Q92995 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP13Q92995 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP13Q92995 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP13Q92995 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP13Q92995 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP13Q92995 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP13Q92995 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP13Q92995 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP13Q92995 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP13Q92995 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP13Q92995 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP13Q92995 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP13Q92995 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP13Q92995 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP13Q92995 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP13Q92995 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP13Q92995 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP13Q92995 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP13Q92995 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP13Q92995 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP13Q92995 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP13Q92995 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP13Q92995 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP13Q92995 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP13Q92995 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP13Q92995 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP13Q92995 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP13Q92995 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP13Q92995 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP13Q92995 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
USP13Q92995 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP13Q92995 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP13Q92995 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP13Q92995 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP13Q92995 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP13Q92995 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP13Q92995 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP13Q92995 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP13Q92995 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP13Q92995 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP13Q92995 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP13Q92995 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP13Q92995 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP13Q92995 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP13Q92995 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP13Q92995 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP13Q92995 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP13Q92995 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP13Q92995 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP13Q92995 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP13Q92995 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP13Q92995 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
USP13Q92995 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP13Q92995 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP13Q92995 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP13Q92995 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP13Q92995 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP13Q92995 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP13Q92995 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP13Q92995 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP13Q92995 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP13Q92995 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP13Q92995 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP13Q92995 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP13Q92995 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP13Q92995 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP13Q92995 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP13Q92995 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP13Q92995 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
USP13Q92995 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP13Q92995 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP13Q92995 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP13Q92995 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP13Q92995 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP13Q92995 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP13Q92995 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP13Q92995 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP13Q92995 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP13Q92995 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP13Q92995 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
USP13Q92995 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP13Q92995 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
USP13Q92995 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP13Q92995 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP13Q92995 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP13Q92995 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP13Q92995 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP13Q92995 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP13Q92995 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP13Q92995 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP13Q92995 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP13Q92995 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP13Q92995 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP13Q92995 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP13Q92995 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms