Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNPO1Q92973 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms