Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GATA6Q92908 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GATA6Q92908 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms