Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
ERCC4Q92889 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC4Q92889 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms