Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TAF4BQ92750 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF4BQ92750 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF4BQ92750 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF4BQ92750 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF4BQ92750 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF4BQ92750 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF4BQ92750 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF4BQ92750 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TAF4BQ92750 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TAF4BQ92750 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TAF4BQ92750 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAF4BQ92750 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAF4BQ92750 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAF4BQ92750 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAF4BQ92750 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAF4BQ92750 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAF4BQ92750 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAF4BQ92750 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAF4BQ92750 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAF4BQ92750 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF4BQ92750 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF4BQ92750 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF4BQ92750 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF4BQ92750 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF4BQ92750 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF4BQ92750 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF4BQ92750 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF4BQ92750 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF4BQ92750 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF4BQ92750 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF4BQ92750 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF4BQ92750 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF4BQ92750 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF4BQ92750 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF4BQ92750 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TAF4BQ92750 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TAF4BQ92750 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TAF4BQ92750 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TAF4BQ92750 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TAF4BQ92750 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TAF4BQ92750 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TAF4BQ92750 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TAF4BQ92750 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF4BQ92750 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF4BQ92750 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF4BQ92750 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF4BQ92750 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF4BQ92750 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF4BQ92750 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF4BQ92750 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF4BQ92750 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF4BQ92750 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF4BQ92750 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF4BQ92750 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF4BQ92750 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF4BQ92750 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF4BQ92750 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF4BQ92750 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF4BQ92750 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF4BQ92750 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF4BQ92750 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF4BQ92750 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAF4BQ92750 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAF4BQ92750 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAF4BQ92750 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAF4BQ92750 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAF4BQ92750 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAF4BQ92750 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF4BQ92750 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF4BQ92750 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF4BQ92750 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF4BQ92750 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF4BQ92750 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF4BQ92750 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF4BQ92750 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF4BQ92750 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF4BQ92750 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF4BQ92750 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF4BQ92750 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms