Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVP7

LMBR1, Limb region 1 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1Q8WVP7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMBR1Q8WVP7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMBR1Q8WVP7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMBR1Q8WVP7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMBR1Q8WVP7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMBR1Q8WVP7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMBR1Q8WVP7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMBR1Q8WVP7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMBR1Q8WVP7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LMBR1Q8WVP7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMBR1Q8WVP7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMBR1Q8WVP7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMBR1Q8WVP7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMBR1Q8WVP7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMBR1Q8WVP7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMBR1Q8WVP7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMBR1Q8WVP7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMBR1Q8WVP7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMBR1Q8WVP7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMBR1Q8WVP7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMBR1Q8WVP7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMBR1Q8WVP7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMBR1Q8WVP7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMBR1Q8WVP7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMBR1Q8WVP7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMBR1Q8WVP7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMBR1Q8WVP7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMBR1Q8WVP7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMBR1Q8WVP7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMBR1Q8WVP7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LMBR1Q8WVP7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMBR1Q8WVP7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMBR1Q8WVP7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMBR1Q8WVP7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMBR1Q8WVP7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMBR1Q8WVP7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMBR1Q8WVP7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMBR1Q8WVP7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
LMBR1Q8WVP7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMBR1Q8WVP7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMBR1Q8WVP7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMBR1Q8WVP7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMBR1Q8WVP7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMBR1Q8WVP7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMBR1Q8WVP7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMBR1Q8WVP7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMBR1Q8WVP7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMBR1Q8WVP7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMBR1Q8WVP7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMBR1Q8WVP7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMBR1Q8WVP7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMBR1Q8WVP7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMBR1Q8WVP7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMBR1Q8WVP7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LMBR1Q8WVP7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms