Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF40

FNIP1, Folliculin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNIP1Q8TF40 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNIP1Q8TF40 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNIP1Q8TF40 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNIP1Q8TF40 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNIP1Q8TF40 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNIP1Q8TF40 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNIP1Q8TF40 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNIP1Q8TF40 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNIP1Q8TF40 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNIP1Q8TF40 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNIP1Q8TF40 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNIP1Q8TF40 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNIP1Q8TF40 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNIP1Q8TF40 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNIP1Q8TF40 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNIP1Q8TF40 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNIP1Q8TF40 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNIP1Q8TF40 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNIP1Q8TF40 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FNIP1Q8TF40 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FNIP1Q8TF40 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FNIP1Q8TF40 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FNIP1Q8TF40 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FNIP1Q8TF40 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FNIP1Q8TF40 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FNIP1Q8TF40 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FNIP1Q8TF40 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FNIP1Q8TF40 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FNIP1Q8TF40 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNIP1Q8TF40 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNIP1Q8TF40 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNIP1Q8TF40 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNIP1Q8TF40 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNIP1Q8TF40 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FNIP1Q8TF40 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNIP1Q8TF40 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FNIP1Q8TF40 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FNIP1Q8TF40 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNIP1Q8TF40 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FNIP1Q8TF40 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FNIP1Q8TF40 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FNIP1Q8TF40 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNIP1Q8TF40 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNIP1Q8TF40 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNIP1Q8TF40 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNIP1Q8TF40 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNIP1Q8TF40 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNIP1Q8TF40 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNIP1Q8TF40 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.6 ms