Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG2

ACTRT1, Actin-related protein T1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT1Q8TDG2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTRT1Q8TDG2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms