Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB24

RIN3, Ras and Rab interactor 3, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIN3Q8TB24 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIN3Q8TB24 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
RIN3Q8TB24 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RIN3Q8TB24 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIN3Q8TB24 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RIN3Q8TB24 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIN3Q8TB24 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIN3Q8TB24 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIN3Q8TB24 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIN3Q8TB24 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIN3Q8TB24 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIN3Q8TB24 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RIN3Q8TB24 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RIN3Q8TB24 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIN3Q8TB24 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RIN3Q8TB24 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIN3Q8TB24 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RIN3Q8TB24 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIN3Q8TB24 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIN3Q8TB24 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIN3Q8TB24 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIN3Q8TB24 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms