Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG27

PJA1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA1Q8NG27 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PJA1Q8NG27 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PJA1Q8NG27 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PJA1Q8NG27 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PJA1Q8NG27 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PJA1Q8NG27 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PJA1Q8NG27 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PJA1Q8NG27 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PJA1Q8NG27 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PJA1Q8NG27 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PJA1Q8NG27 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PJA1Q8NG27 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PJA1Q8NG27 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PJA1Q8NG27 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PJA1Q8NG27 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PJA1Q8NG27 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PJA1Q8NG27 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PJA1Q8NG27 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PJA1Q8NG27 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PJA1Q8NG27 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PJA1Q8NG27 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PJA1Q8NG27 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PJA1Q8NG27 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PJA1Q8NG27 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PJA1Q8NG27 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PJA1Q8NG27 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PJA1Q8NG27 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PJA1Q8NG27 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PJA1Q8NG27 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PJA1Q8NG27 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PJA1Q8NG27 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PJA1Q8NG27 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PJA1Q8NG27 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PJA1Q8NG27 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PJA1Q8NG27 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PJA1Q8NG27 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PJA1Q8NG27 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PJA1Q8NG27 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PJA1Q8NG27 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PJA1Q8NG27 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PJA1Q8NG27 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PJA1Q8NG27 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PJA1Q8NG27 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PJA1Q8NG27 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PJA1Q8NG27 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PJA1Q8NG27 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PJA1Q8NG27 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PJA1Q8NG27 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PJA1Q8NG27 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PJA1Q8NG27 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PJA1Q8NG27 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PJA1Q8NG27 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PJA1Q8NG27 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PJA1Q8NG27 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PJA1Q8NG27 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PJA1Q8NG27 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PJA1Q8NG27 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PJA1Q8NG27 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PJA1Q8NG27 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PJA1Q8NG27 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PJA1Q8NG27 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PJA1Q8NG27 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PJA1Q8NG27 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PJA1Q8NG27 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PJA1Q8NG27 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PJA1Q8NG27 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PJA1Q8NG27 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PJA1Q8NG27 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PJA1Q8NG27 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PJA1Q8NG27 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PJA1Q8NG27 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PJA1Q8NG27 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PJA1Q8NG27 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PJA1Q8NG27 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PJA1Q8NG27 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PJA1Q8NG27 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PJA1Q8NG27 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PJA1Q8NG27 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PJA1Q8NG27 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PJA1Q8NG27 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PJA1Q8NG27 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PJA1Q8NG27 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PJA1Q8NG27 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PJA1Q8NG27 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PJA1Q8NG27 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PJA1Q8NG27 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PJA1Q8NG27 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PJA1Q8NG27 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PJA1Q8NG27 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PJA1Q8NG27 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PJA1Q8NG27 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PJA1Q8NG27 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PJA1Q8NG27 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PJA1Q8NG27 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PJA1Q8NG27 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PJA1Q8NG27 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PJA1Q8NG27 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PJA1Q8NG27 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PJA1Q8NG27 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PJA1Q8NG27 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms