Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms