Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK2A3Q8NEV1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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