Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF548Q8NEK5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
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