Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEG4

FAM83F, Protein FAM83F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM83FQ8NEG4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM83FQ8NEG4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM83FQ8NEG4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.5 ms