Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms