Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCX0

CCDC150, Coiled-coil domain-containing protein 150, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC150Q8NCX0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC150Q8NCX0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC150Q8NCX0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC150Q8NCX0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC150Q8NCX0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC150Q8NCX0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC150Q8NCX0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC150Q8NCX0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC150Q8NCX0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC150Q8NCX0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC150Q8NCX0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC150Q8NCX0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC150Q8NCX0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC150Q8NCX0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC150Q8NCX0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC150Q8NCX0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC150Q8NCX0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC150Q8NCX0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC150Q8NCX0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC150Q8NCX0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC150Q8NCX0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC150Q8NCX0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC150Q8NCX0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC150Q8NCX0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC150Q8NCX0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC150Q8NCX0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC150Q8NCX0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC150Q8NCX0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC150Q8NCX0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC150Q8NCX0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC150Q8NCX0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC150Q8NCX0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC150Q8NCX0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC150Q8NCX0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC150Q8NCX0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC150Q8NCX0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC150Q8NCX0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC150Q8NCX0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC150Q8NCX0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC150Q8NCX0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC150Q8NCX0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC150Q8NCX0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC150Q8NCX0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC150Q8NCX0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC150Q8NCX0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC150Q8NCX0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC150Q8NCX0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC150Q8NCX0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC150Q8NCX0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC150Q8NCX0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC150Q8NCX0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC150Q8NCX0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC150Q8NCX0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC150Q8NCX0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC150Q8NCX0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms