Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPC24Q8NBT2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPC24Q8NBT2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPC24Q8NBT2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPC24Q8NBT2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPC24Q8NBT2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPC24Q8NBT2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPC24Q8NBT2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPC24Q8NBT2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPC24Q8NBT2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPC24Q8NBT2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPC24Q8NBT2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPC24Q8NBT2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPC24Q8NBT2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SPC24Q8NBT2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPC24Q8NBT2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPC24Q8NBT2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPC24Q8NBT2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPC24Q8NBT2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPC24Q8NBT2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPC24Q8NBT2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPC24Q8NBT2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPC24Q8NBT2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPC24Q8NBT2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPC24Q8NBT2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPC24Q8NBT2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPC24Q8NBT2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPC24Q8NBT2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPC24Q8NBT2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPC24Q8NBT2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPC24Q8NBT2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPC24Q8NBT2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPC24Q8NBT2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPC24Q8NBT2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPC24Q8NBT2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPC24Q8NBT2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPC24Q8NBT2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPC24Q8NBT2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPC24Q8NBT2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms