Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COLGALT1Q8NBJ5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COLGALT1Q8NBJ5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COLGALT1Q8NBJ5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COLGALT1Q8NBJ5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
COLGALT1Q8NBJ5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COLGALT1Q8NBJ5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COLGALT1Q8NBJ5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COLGALT1Q8NBJ5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COLGALT1Q8NBJ5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COLGALT1Q8NBJ5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COLGALT1Q8NBJ5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COLGALT1Q8NBJ5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COLGALT1Q8NBJ5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COLGALT1Q8NBJ5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COLGALT1Q8NBJ5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
COLGALT1Q8NBJ5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COLGALT1Q8NBJ5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COLGALT1Q8NBJ5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COLGALT1Q8NBJ5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
COLGALT1Q8NBJ5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COLGALT1Q8NBJ5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
COLGALT1Q8NBJ5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
COLGALT1Q8NBJ5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COLGALT1Q8NBJ5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COLGALT1Q8NBJ5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COLGALT1Q8NBJ5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COLGALT1Q8NBJ5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COLGALT1Q8NBJ5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
COLGALT1Q8NBJ5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
COLGALT1Q8NBJ5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COLGALT1Q8NBJ5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COLGALT1Q8NBJ5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COLGALT1Q8NBJ5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
COLGALT1Q8NBJ5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COLGALT1Q8NBJ5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COLGALT1Q8NBJ5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
COLGALT1Q8NBJ5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COLGALT1Q8NBJ5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COLGALT1Q8NBJ5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COLGALT1Q8NBJ5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COLGALT1Q8NBJ5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COLGALT1Q8NBJ5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms