Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNLDC1Q8NA58 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms