Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms