Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5H7

SH2D3C, SH2 domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D3CQ8N5H7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH2D3CQ8N5H7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH2D3CQ8N5H7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH2D3CQ8N5H7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2D3CQ8N5H7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2D3CQ8N5H7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2D3CQ8N5H7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2D3CQ8N5H7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2D3CQ8N5H7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2D3CQ8N5H7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2D3CQ8N5H7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2D3CQ8N5H7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2D3CQ8N5H7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2D3CQ8N5H7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2D3CQ8N5H7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH2D3CQ8N5H7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH2D3CQ8N5H7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SH2D3CQ8N5H7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH2D3CQ8N5H7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH2D3CQ8N5H7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH2D3CQ8N5H7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH2D3CQ8N5H7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH2D3CQ8N5H7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH2D3CQ8N5H7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH2D3CQ8N5H7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH2D3CQ8N5H7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SH2D3CQ8N5H7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH2D3CQ8N5H7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH2D3CQ8N5H7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2D3CQ8N5H7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms