Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVBPQ8N300 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SVBPQ8N300 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SVBPQ8N300 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms